中国农业科学院农业资源与农业区划研究主要以土壤肥料、农业资源利用和区域发展为主导的国家级公益性综合研究机构。研究所围绕现代农业发展、国家粮食安全和生态文明建设中的国家战略需求，以及农业资源与环境学科的科学前沿，建成为：世界一流的农业资源与环境领域的综合研究机构；国家农业资源高效利用、动态监测和科学管理，以及农业生态环境建设中，不可替代的国家级公益性、社会性研究所；农业资源与环境领域国家高层次人才培养基地。